本分局為政府機關，隸屬於經濟部標準檢驗局，承總局之指揮監督，推動及辦理標準法、商品檢驗法及度量衡法之相關業務。

主要任務為執行花蓮縣(市)、臺東縣(市)等地區之檢驗標準提供，度量衡事務，法定商品檢驗、特約檢驗、受託試驗、管理系統驗證、正字標記管理、產品驗證（驗證登錄）、商品型式認可、工廠檢查、自願性產品驗證、技術服務、產地證明書核發及服務等相關業務。

本分局基於服務需求，設置2個服務場所，包含花蓮分局本部及臺東辦事處，以服務不同屬性及不同區域之民眾及廠商。

本分局設第一至五課、秘書室、主計室、人事室、政風室、臺東辦事處共10個單位。各業務單位職掌為

第一課：電機、機械類商品及正字標記綜合業務

第二課：化工類商品檢驗業務

第三課︰市場監督業務

第四課：度量衡器檢定檢查業務

第五課︰報驗發證與標準資料服務

臺東辦事處：臺東地區報驗發證檢驗（定）

秘書室：辦理綜核文稿、機要、文書、法制、印信、出納、庶務、公共關係、研考等業務。

人事室：辦理本分局員工有關組織、任免、考核訓練、待遇福利等業務。

政風室：辦理政風預防、查處、公務機密維護、危害或破壞事件預防等業務。

主計室：辦理本分局歲計、會計、統計等業務。