本分局為政府機關，隸屬於經濟部標準檢驗局，承總局之指揮監督，推動及辦理標準法、商品檢驗法及度量衡法之相關業務。

主要任務為執行花蓮縣(市)、臺東縣(市)等地區之檢驗標準提供，度量衡事務，法定商品檢驗、特約檢驗、受託試驗、管理系統驗證、正字標記管理、產品驗證（驗證登錄）、商品型式認可、工廠檢查、自願性產品驗證、技術服務、產地證明書核發及服務等相關業務。

本分局基於服務需求，設置2個服務場所，包含花蓮分局本部及臺東辦事處，以服務不同屬性及不同區域之民眾及廠商。

本分局設機電產品科、化工產品科、度量衡科、報驗發證科、市場監督科、秘書室、人事室、政風室、主計室、臺東辦事處共10個單位。各業務單位職掌簡介

機電產品科：電機、電子、資訊與機械類商品及正字標記綜合業務

化工產品科：化工類商品檢驗業務

度量衡科：度量衡器檢查(定)及其他相關業務

報驗發證科︰報驗發證與標準資料服務、資訊及資安業務

市場監督科︰市場監督業務

秘書室：辦理綜核文稿、文書、印信、出納、庶務、研考等業務。

人事室：辦理本分局員工有關組織、任免、考核訓練、待遇福利等業務。

政風室：辦理政風預防、查處、公務機密維護、危害或破壞事件預防等業務。

主計室：辦理本分局歲計、會計、統計等業務。

臺東辦事處：臺東地區報驗發證、檢查（定）